Protein–RNA interactions for Protein: E9PW72

Gm3002, Predicted gene 3002, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3002E9PW72 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm3002E9PW72 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm3002E9PW72 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm3002E9PW72 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm3002E9PW72 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm3002E9PW72 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm3002E9PW72 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm3002E9PW72 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm3002E9PW72 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm3002E9PW72 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm3002E9PW72 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm3002E9PW72 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm3002E9PW72 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm3002E9PW72 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm3002E9PW72 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm3002E9PW72 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm3002E9PW72 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm3002E9PW72 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm3002E9PW72 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm3002E9PW72 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm3002E9PW72 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm3002E9PW72 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm3002E9PW72 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm3002E9PW72 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm3002E9PW72 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm3002E9PW72 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm3002E9PW72 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm3002E9PW72 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm3002E9PW72 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm3002E9PW72 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm3002E9PW72 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm3002E9PW72 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm3002E9PW72 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm3002E9PW72 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm3002E9PW72 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm3002E9PW72 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm3002E9PW72 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm3002E9PW72 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm3002E9PW72 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm3002E9PW72 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm3002E9PW72 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm3002E9PW72 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm3002E9PW72 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm3002E9PW72 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm3002E9PW72 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm3002E9PW72 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm3002E9PW72 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm3002E9PW72 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm3002E9PW72 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm3002E9PW72 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm3002E9PW72 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm3002E9PW72 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm3002E9PW72 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm3002E9PW72 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm3002E9PW72 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm3002E9PW72 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm3002E9PW72 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm3002E9PW72 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm3002E9PW72 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm3002E9PW72 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm3002E9PW72 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm3002E9PW72 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm3002E9PW72 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm3002E9PW72 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm3002E9PW72 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm3002E9PW72 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm3002E9PW72 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm3002E9PW72 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm3002E9PW72 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm3002E9PW72 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm3002E9PW72 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm3002E9PW72 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm3002E9PW72 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm3002E9PW72 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm3002E9PW72 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm3002E9PW72 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm3002E9PW72 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm3002E9PW72 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm3002E9PW72 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm3002E9PW72 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm3002E9PW72 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm3002E9PW72 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm3002E9PW72 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm3002E9PW72 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm3002E9PW72 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm3002E9PW72 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm3002E9PW72 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm3002E9PW72 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm3002E9PW72 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm3002E9PW72 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm3002E9PW72 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm3002E9PW72 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm3002E9PW72 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm3002E9PW72 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm3002E9PW72 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm3002E9PW72 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm3002E9PW72 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm3002E9PW72 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm3002E9PW72 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm3002E9PW72 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms