Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms