Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6W3

Rdh8, Retinol dehydrogenase 8, mousemouse

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Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh8D3Z6W3 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rdh8D3Z6W3 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rdh8D3Z6W3 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rdh8D3Z6W3 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rdh8D3Z6W3 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rdh8D3Z6W3 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rdh8D3Z6W3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rdh8D3Z6W3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rdh8D3Z6W3 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Rdh8D3Z6W3 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rdh8D3Z6W3 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rdh8D3Z6W3 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rdh8D3Z6W3 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rdh8D3Z6W3 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rdh8D3Z6W3 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rdh8D3Z6W3 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rdh8D3Z6W3 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rdh8D3Z6W3 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rdh8D3Z6W3 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rdh8D3Z6W3 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rdh8D3Z6W3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rdh8D3Z6W3 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rdh8D3Z6W3 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rdh8D3Z6W3 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rdh8D3Z6W3 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rdh8D3Z6W3 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Rdh8D3Z6W3 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rdh8D3Z6W3 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rdh8D3Z6W3 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rdh8D3Z6W3 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rdh8D3Z6W3 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rdh8D3Z6W3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rdh8D3Z6W3 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rdh8D3Z6W3 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rdh8D3Z6W3 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rdh8D3Z6W3 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Rdh8D3Z6W3 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rdh8D3Z6W3 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rdh8D3Z6W3 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rdh8D3Z6W3 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rdh8D3Z6W3 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rdh8D3Z6W3 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rdh8D3Z6W3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rdh8D3Z6W3 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rdh8D3Z6W3 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rdh8D3Z6W3 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rdh8D3Z6W3 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rdh8D3Z6W3 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rdh8D3Z6W3 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rdh8D3Z6W3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rdh8D3Z6W3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rdh8D3Z6W3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rdh8D3Z6W3 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rdh8D3Z6W3 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rdh8D3Z6W3 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rdh8D3Z6W3 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rdh8D3Z6W3 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rdh8D3Z6W3 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rdh8D3Z6W3 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rdh8D3Z6W3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rdh8D3Z6W3 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rdh8D3Z6W3 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rdh8D3Z6W3 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rdh8D3Z6W3 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rdh8D3Z6W3 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rdh8D3Z6W3 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rdh8D3Z6W3 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rdh8D3Z6W3 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rdh8D3Z6W3 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rdh8D3Z6W3 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rdh8D3Z6W3 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rdh8D3Z6W3 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rdh8D3Z6W3 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rdh8D3Z6W3 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rdh8D3Z6W3 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rdh8D3Z6W3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rdh8D3Z6W3 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rdh8D3Z6W3 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rdh8D3Z6W3 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rdh8D3Z6W3 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rdh8D3Z6W3 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rdh8D3Z6W3 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rdh8D3Z6W3 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rdh8D3Z6W3 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rdh8D3Z6W3 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Rdh8D3Z6W3 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rdh8D3Z6W3 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rdh8D3Z6W3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rdh8D3Z6W3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rdh8D3Z6W3 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rdh8D3Z6W3 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Rdh8D3Z6W3 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rdh8D3Z6W3 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rdh8D3Z6W3 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rdh8D3Z6W3 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Rdh8D3Z6W3 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rdh8D3Z6W3 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rdh8D3Z6W3 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rdh8D3Z6W3 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rdh8D3Z6W3 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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