Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5W0

Atp6ap1l, ATPase, H+-transporting, lysosomal accessory protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6ap1lD3Z5W0 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp6ap1lD3Z5W0 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp6ap1lD3Z5W0 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp6ap1lD3Z5W0 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp6ap1lD3Z5W0 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp6ap1lD3Z5W0 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp6ap1lD3Z5W0 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp6ap1lD3Z5W0 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp6ap1lD3Z5W0 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms