Protein–RNA interactions for Protein: D3Z235

Gm3543, Predicted gene 3543, mousemouse

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3543D3Z235 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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