Protein–RNA interactions for Protein: D3YZZ2

Tgfbr3l, Transforming growth factor, beta receptor III-like, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfbr3lD3YZZ2 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms