Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

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Length 469 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc6D3YZP9 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc6D3YZP9 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc6D3YZP9 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc6D3YZP9 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc6D3YZP9 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc6D3YZP9 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc6D3YZP9 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc6D3YZP9 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc6D3YZP9 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc6D3YZP9 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc6D3YZP9 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc6D3YZP9 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc6D3YZP9 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc6D3YZP9 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc6D3YZP9 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc6D3YZP9 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc6D3YZP9 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc6D3YZP9 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc6D3YZP9 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc6D3YZP9 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc6D3YZP9 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc6D3YZP9 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc6D3YZP9 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc6D3YZP9 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc6D3YZP9 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc6D3YZP9 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc6D3YZP9 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc6D3YZP9 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc6D3YZP9 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc6D3YZP9 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc6D3YZP9 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc6D3YZP9 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc6D3YZP9 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc6D3YZP9 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc6D3YZP9 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc6D3YZP9 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc6D3YZP9 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc6D3YZP9 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc6D3YZP9 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc6D3YZP9 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc6D3YZP9 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc6D3YZP9 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc6D3YZP9 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc6D3YZP9 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc6D3YZP9 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc6D3YZP9 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc6D3YZP9 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc6D3YZP9 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc6D3YZP9 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc6D3YZP9 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc6D3YZP9 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc6D3YZP9 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc6D3YZP9 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc6D3YZP9 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc6D3YZP9 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc6D3YZP9 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc6D3YZP9 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc6D3YZP9 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc6D3YZP9 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc6D3YZP9 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc6D3YZP9 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc6D3YZP9 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc6D3YZP9 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc6D3YZP9 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc6D3YZP9 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc6D3YZP9 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc6D3YZP9 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc6D3YZP9 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc6D3YZP9 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc6D3YZP9 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc6D3YZP9 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc6D3YZP9 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc6D3YZP9 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc6D3YZP9 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc6D3YZP9 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc6D3YZP9 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc6D3YZP9 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc6D3YZP9 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc6D3YZP9 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc6D3YZP9 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc6D3YZP9 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc6D3YZP9 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc6D3YZP9 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc6D3YZP9 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc6D3YZP9 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc6D3YZP9 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc6D3YZP9 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc6D3YZP9 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc6D3YZP9 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc6D3YZP9 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc6D3YZP9 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc6D3YZP9 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc6D3YZP9 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc6D3YZP9 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc6D3YZP9 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc6D3YZP9 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc6D3YZP9 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc6D3YZP9 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc6D3YZP9 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
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