Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms