Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK2

Safb, Scaffold attachment factor B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SafbD3YXK2 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SafbD3YXK2 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SafbD3YXK2 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SafbD3YXK2 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SafbD3YXK2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SafbD3YXK2 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SafbD3YXK2 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SafbD3YXK2 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SafbD3YXK2 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SafbD3YXK2 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SafbD3YXK2 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SafbD3YXK2 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SafbD3YXK2 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SafbD3YXK2 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SafbD3YXK2 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SafbD3YXK2 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SafbD3YXK2 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SafbD3YXK2 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SafbD3YXK2 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SafbD3YXK2 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SafbD3YXK2 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
SafbD3YXK2 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SafbD3YXK2 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SafbD3YXK2 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SafbD3YXK2 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SafbD3YXK2 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
SafbD3YXK2 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
SafbD3YXK2 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SafbD3YXK2 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SafbD3YXK2 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SafbD3YXK2 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SafbD3YXK2 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SafbD3YXK2 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SafbD3YXK2 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SafbD3YXK2 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SafbD3YXK2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SafbD3YXK2 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SafbD3YXK2 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SafbD3YXK2 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SafbD3YXK2 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SafbD3YXK2 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SafbD3YXK2 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SafbD3YXK2 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SafbD3YXK2 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SafbD3YXK2 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SafbD3YXK2 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SafbD3YXK2 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SafbD3YXK2 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SafbD3YXK2 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SafbD3YXK2 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SafbD3YXK2 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SafbD3YXK2 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SafbD3YXK2 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SafbD3YXK2 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SafbD3YXK2 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SafbD3YXK2 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SafbD3YXK2 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SafbD3YXK2 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SafbD3YXK2 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SafbD3YXK2 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SafbD3YXK2 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SafbD3YXK2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SafbD3YXK2 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SafbD3YXK2 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SafbD3YXK2 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SafbD3YXK2 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SafbD3YXK2 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SafbD3YXK2 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SafbD3YXK2 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SafbD3YXK2 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SafbD3YXK2 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SafbD3YXK2 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SafbD3YXK2 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SafbD3YXK2 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SafbD3YXK2 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SafbD3YXK2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SafbD3YXK2 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SafbD3YXK2 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SafbD3YXK2 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SafbD3YXK2 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SafbD3YXK2 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SafbD3YXK2 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SafbD3YXK2 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SafbD3YXK2 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SafbD3YXK2 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SafbD3YXK2 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SafbD3YXK2 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SafbD3YXK2 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SafbD3YXK2 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SafbD3YXK2 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SafbD3YXK2 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SafbD3YXK2 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SafbD3YXK2 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SafbD3YXK2 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SafbD3YXK2 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SafbD3YXK2 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SafbD3YXK2 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SafbD3YXK2 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SafbD3YXK2 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SafbD3YXK2 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms