Protein–RNA interactions for Protein: D3YWC7

Fam47e, Family with sequence similarity 47, member E, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam47eD3YWC7 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam47eD3YWC7 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam47eD3YWC7 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam47eD3YWC7 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam47eD3YWC7 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam47eD3YWC7 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam47eD3YWC7 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam47eD3YWC7 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Fam47eD3YWC7 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam47eD3YWC7 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam47eD3YWC7 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam47eD3YWC7 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam47eD3YWC7 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Fam47eD3YWC7 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Fam47eD3YWC7 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Fam47eD3YWC7 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam47eD3YWC7 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Fam47eD3YWC7 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Fam47eD3YWC7 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam47eD3YWC7 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam47eD3YWC7 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Fam47eD3YWC7 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam47eD3YWC7 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam47eD3YWC7 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam47eD3YWC7 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam47eD3YWC7 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam47eD3YWC7 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam47eD3YWC7 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam47eD3YWC7 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam47eD3YWC7 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam47eD3YWC7 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam47eD3YWC7 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam47eD3YWC7 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam47eD3YWC7 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam47eD3YWC7 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam47eD3YWC7 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam47eD3YWC7 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam47eD3YWC7 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam47eD3YWC7 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam47eD3YWC7 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam47eD3YWC7 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam47eD3YWC7 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam47eD3YWC7 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam47eD3YWC7 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam47eD3YWC7 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam47eD3YWC7 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam47eD3YWC7 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam47eD3YWC7 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam47eD3YWC7 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam47eD3YWC7 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam47eD3YWC7 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam47eD3YWC7 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam47eD3YWC7 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam47eD3YWC7 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam47eD3YWC7 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam47eD3YWC7 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam47eD3YWC7 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam47eD3YWC7 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam47eD3YWC7 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam47eD3YWC7 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam47eD3YWC7 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam47eD3YWC7 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam47eD3YWC7 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam47eD3YWC7 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam47eD3YWC7 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam47eD3YWC7 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam47eD3YWC7 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam47eD3YWC7 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam47eD3YWC7 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam47eD3YWC7 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam47eD3YWC7 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam47eD3YWC7 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam47eD3YWC7 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam47eD3YWC7 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam47eD3YWC7 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam47eD3YWC7 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam47eD3YWC7 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam47eD3YWC7 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam47eD3YWC7 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam47eD3YWC7 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam47eD3YWC7 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam47eD3YWC7 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam47eD3YWC7 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam47eD3YWC7 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam47eD3YWC7 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam47eD3YWC7 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam47eD3YWC7 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam47eD3YWC7 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam47eD3YWC7 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam47eD3YWC7 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam47eD3YWC7 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam47eD3YWC7 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam47eD3YWC7 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam47eD3YWC7 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam47eD3YWC7 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam47eD3YWC7 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam47eD3YWC7 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam47eD3YWC7 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam47eD3YWC7 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam47eD3YWC7 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms