Protein–RNA interactions for Protein: D3YUK0

Gm3259, Predicted gene 3259, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3259D3YUK0 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3259D3YUK0 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3259D3YUK0 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3259D3YUK0 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3259D3YUK0 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3259D3YUK0 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3259D3YUK0 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3259D3YUK0 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3259D3YUK0 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3259D3YUK0 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3259D3YUK0 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3259D3YUK0 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3259D3YUK0 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3259D3YUK0 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3259D3YUK0 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3259D3YUK0 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3259D3YUK0 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3259D3YUK0 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3259D3YUK0 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3259D3YUK0 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3259D3YUK0 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3259D3YUK0 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3259D3YUK0 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3259D3YUK0 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3259D3YUK0 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3259D3YUK0 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3259D3YUK0 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3259D3YUK0 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3259D3YUK0 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3259D3YUK0 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3259D3YUK0 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3259D3YUK0 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3259D3YUK0 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3259D3YUK0 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3259D3YUK0 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3259D3YUK0 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3259D3YUK0 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3259D3YUK0 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3259D3YUK0 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3259D3YUK0 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3259D3YUK0 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3259D3YUK0 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3259D3YUK0 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3259D3YUK0 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3259D3YUK0 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3259D3YUK0 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3259D3YUK0 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3259D3YUK0 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3259D3YUK0 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3259D3YUK0 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3259D3YUK0 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3259D3YUK0 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3259D3YUK0 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3259D3YUK0 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3259D3YUK0 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3259D3YUK0 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3259D3YUK0 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3259D3YUK0 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3259D3YUK0 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3259D3YUK0 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3259D3YUK0 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3259D3YUK0 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3259D3YUK0 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3259D3YUK0 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3259D3YUK0 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3259D3YUK0 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3259D3YUK0 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3259D3YUK0 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3259D3YUK0 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3259D3YUK0 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3259D3YUK0 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3259D3YUK0 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3259D3YUK0 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3259D3YUK0 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3259D3YUK0 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3259D3YUK0 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3259D3YUK0 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3259D3YUK0 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3259D3YUK0 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3259D3YUK0 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3259D3YUK0 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3259D3YUK0 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3259D3YUK0 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3259D3YUK0 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3259D3YUK0 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3259D3YUK0 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3259D3YUK0 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3259D3YUK0 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3259D3YUK0 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3259D3YUK0 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3259D3YUK0 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3259D3YUK0 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3259D3YUK0 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3259D3YUK0 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3259D3YUK0 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3259D3YUK0 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3259D3YUK0 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3259D3YUK0 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3259D3YUK0 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3259D3YUK0 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms