Protein–RNA interactions for Protein: C0LLJ0

Kpna7, Importin subunit alpha-8, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna7C0LLJ0 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kpna7C0LLJ0 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kpna7C0LLJ0 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kpna7C0LLJ0 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kpna7C0LLJ0 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kpna7C0LLJ0 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kpna7C0LLJ0 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kpna7C0LLJ0 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kpna7C0LLJ0 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kpna7C0LLJ0 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kpna7C0LLJ0 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Kpna7C0LLJ0 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Kpna7C0LLJ0 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kpna7C0LLJ0 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kpna7C0LLJ0 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kpna7C0LLJ0 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kpna7C0LLJ0 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kpna7C0LLJ0 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kpna7C0LLJ0 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kpna7C0LLJ0 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kpna7C0LLJ0 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kpna7C0LLJ0 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kpna7C0LLJ0 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kpna7C0LLJ0 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kpna7C0LLJ0 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kpna7C0LLJ0 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kpna7C0LLJ0 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Kpna7C0LLJ0 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Kpna7C0LLJ0 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kpna7C0LLJ0 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Kpna7C0LLJ0 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kpna7C0LLJ0 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kpna7C0LLJ0 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms