Protein–RNA interactions for Protein: B9EKR1

Ptprz1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, mousemouse

Predictions only

Length 2,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprz1B9EKR1 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ptprz1B9EKR1 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms