Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cttnbp2B9EJA2 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Cttnbp2B9EJA2 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Cttnbp2B9EJA2 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cttnbp2B9EJA2 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cttnbp2B9EJA2 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cttnbp2B9EJA2 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cttnbp2B9EJA2 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Cttnbp2B9EJA2 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cttnbp2B9EJA2 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cttnbp2B9EJA2 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Cttnbp2B9EJA2 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cttnbp2B9EJA2 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cttnbp2B9EJA2 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cttnbp2B9EJA2 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cttnbp2B9EJA2 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cttnbp2B9EJA2 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cttnbp2B9EJA2 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cttnbp2B9EJA2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cttnbp2B9EJA2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cttnbp2B9EJA2 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cttnbp2B9EJA2 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cttnbp2B9EJA2 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cttnbp2B9EJA2 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cttnbp2B9EJA2 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cttnbp2B9EJA2 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cttnbp2B9EJA2 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Cttnbp2B9EJA2 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cttnbp2B9EJA2 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cttnbp2B9EJA2 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cttnbp2B9EJA2 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cttnbp2B9EJA2 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cttnbp2B9EJA2 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cttnbp2B9EJA2 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cttnbp2B9EJA2 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Cttnbp2B9EJA2 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cttnbp2B9EJA2 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cttnbp2B9EJA2 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cttnbp2B9EJA2 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cttnbp2B9EJA2 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cttnbp2B9EJA2 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cttnbp2B9EJA2 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cttnbp2B9EJA2 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cttnbp2B9EJA2 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cttnbp2B9EJA2 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cttnbp2B9EJA2 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cttnbp2B9EJA2 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cttnbp2B9EJA2 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Cttnbp2B9EJA2 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cttnbp2B9EJA2 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cttnbp2B9EJA2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cttnbp2B9EJA2 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cttnbp2B9EJA2 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cttnbp2B9EJA2 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cttnbp2B9EJA2 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cttnbp2B9EJA2 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cttnbp2B9EJA2 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cttnbp2B9EJA2 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cttnbp2B9EJA2 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Cttnbp2B9EJA2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
Cttnbp2B9EJA2 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Cttnbp2B9EJA2 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
Cttnbp2B9EJA2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Cttnbp2B9EJA2 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Cttnbp2B9EJA2 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Cttnbp2B9EJA2 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Cttnbp2B9EJA2 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Cttnbp2B9EJA2 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Cttnbp2B9EJA2 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cttnbp2B9EJA2 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cttnbp2B9EJA2 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cttnbp2B9EJA2 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cttnbp2B9EJA2 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cttnbp2B9EJA2 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cttnbp2B9EJA2 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cttnbp2B9EJA2 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Cttnbp2B9EJA2 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cttnbp2B9EJA2 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cttnbp2B9EJA2 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Cttnbp2B9EJA2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cttnbp2B9EJA2 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cttnbp2B9EJA2 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cttnbp2B9EJA2 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Cttnbp2B9EJA2 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cttnbp2B9EJA2 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cttnbp2B9EJA2 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cttnbp2B9EJA2 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cttnbp2B9EJA2 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cttnbp2B9EJA2 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Cttnbp2B9EJA2 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cttnbp2B9EJA2 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cttnbp2B9EJA2 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cttnbp2B9EJA2 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cttnbp2B9EJA2 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cttnbp2B9EJA2 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Cttnbp2B9EJA2 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cttnbp2B9EJA2 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cttnbp2B9EJA2 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cttnbp2B9EJA2 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cttnbp2B9EJA2 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms