Protein–RNA interactions for Protein: B7ZC55

Apol6, Apolipoprotein L 6, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol6B7ZC55 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apol6B7ZC55 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apol6B7ZC55 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apol6B7ZC55 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apol6B7ZC55 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apol6B7ZC55 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apol6B7ZC55 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apol6B7ZC55 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apol6B7ZC55 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apol6B7ZC55 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apol6B7ZC55 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apol6B7ZC55 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apol6B7ZC55 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apol6B7ZC55 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apol6B7ZC55 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Apol6B7ZC55 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apol6B7ZC55 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apol6B7ZC55 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apol6B7ZC55 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apol6B7ZC55 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apol6B7ZC55 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apol6B7ZC55 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apol6B7ZC55 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Apol6B7ZC55 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apol6B7ZC55 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apol6B7ZC55 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apol6B7ZC55 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apol6B7ZC55 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Apol6B7ZC55 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apol6B7ZC55 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apol6B7ZC55 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apol6B7ZC55 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apol6B7ZC55 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apol6B7ZC55 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apol6B7ZC55 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apol6B7ZC55 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apol6B7ZC55 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apol6B7ZC55 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apol6B7ZC55 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apol6B7ZC55 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apol6B7ZC55 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apol6B7ZC55 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Apol6B7ZC55 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Apol6B7ZC55 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apol6B7ZC55 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apol6B7ZC55 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apol6B7ZC55 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Apol6B7ZC55 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Apol6B7ZC55 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Apol6B7ZC55 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Apol6B7ZC55 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Apol6B7ZC55 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Apol6B7ZC55 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apol6B7ZC55 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apol6B7ZC55 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apol6B7ZC55 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apol6B7ZC55 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apol6B7ZC55 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apol6B7ZC55 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apol6B7ZC55 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apol6B7ZC55 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apol6B7ZC55 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apol6B7ZC55 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apol6B7ZC55 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apol6B7ZC55 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apol6B7ZC55 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apol6B7ZC55 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apol6B7ZC55 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apol6B7ZC55 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apol6B7ZC55 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apol6B7ZC55 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Apol6B7ZC55 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Apol6B7ZC55 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apol6B7ZC55 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apol6B7ZC55 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apol6B7ZC55 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apol6B7ZC55 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apol6B7ZC55 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apol6B7ZC55 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apol6B7ZC55 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apol6B7ZC55 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apol6B7ZC55 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apol6B7ZC55 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apol6B7ZC55 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apol6B7ZC55 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apol6B7ZC55 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apol6B7ZC55 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apol6B7ZC55 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apol6B7ZC55 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apol6B7ZC55 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apol6B7ZC55 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Apol6B7ZC55 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Apol6B7ZC55 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apol6B7ZC55 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Apol6B7ZC55 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Apol6B7ZC55 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apol6B7ZC55 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Apol6B7ZC55 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apol6B7ZC55 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apol6B7ZC55 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms