Protein–RNA interactions for Protein: B2RY53

Gm6133, EG620155 protein, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6133B2RY53 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm6133B2RY53 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm6133B2RY53 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm6133B2RY53 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm6133B2RY53 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm6133B2RY53 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm6133B2RY53 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm6133B2RY53 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm6133B2RY53 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm6133B2RY53 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm6133B2RY53 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm6133B2RY53 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm6133B2RY53 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm6133B2RY53 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm6133B2RY53 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm6133B2RY53 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm6133B2RY53 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm6133B2RY53 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm6133B2RY53 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm6133B2RY53 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm6133B2RY53 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm6133B2RY53 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm6133B2RY53 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms