Protein–RNA interactions for Protein: B2RUR8

Otud7b, OTU domain-containing protein 7B, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud7bB2RUR8 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Otud7bB2RUR8 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Otud7bB2RUR8 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Otud7bB2RUR8 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Otud7bB2RUR8 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Otud7bB2RUR8 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Otud7bB2RUR8 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Otud7bB2RUR8 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Otud7bB2RUR8 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Otud7bB2RUR8 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Otud7bB2RUR8 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Otud7bB2RUR8 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Otud7bB2RUR8 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Otud7bB2RUR8 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Otud7bB2RUR8 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Otud7bB2RUR8 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Otud7bB2RUR8 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Otud7bB2RUR8 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Otud7bB2RUR8 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Otud7bB2RUR8 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Otud7bB2RUR8 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Otud7bB2RUR8 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Otud7bB2RUR8 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Otud7bB2RUR8 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Otud7bB2RUR8 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Otud7bB2RUR8 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Otud7bB2RUR8 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Otud7bB2RUR8 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Otud7bB2RUR8 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Otud7bB2RUR8 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Otud7bB2RUR8 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Otud7bB2RUR8 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Otud7bB2RUR8 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Otud7bB2RUR8 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Otud7bB2RUR8 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Otud7bB2RUR8 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Otud7bB2RUR8 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Otud7bB2RUR8 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Otud7bB2RUR8 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Otud7bB2RUR8 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Otud7bB2RUR8 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Otud7bB2RUR8 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Otud7bB2RUR8 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Otud7bB2RUR8 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Otud7bB2RUR8 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Otud7bB2RUR8 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Otud7bB2RUR8 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Otud7bB2RUR8 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Otud7bB2RUR8 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Otud7bB2RUR8 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Otud7bB2RUR8 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Otud7bB2RUR8 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Otud7bB2RUR8 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Otud7bB2RUR8 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Otud7bB2RUR8 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Otud7bB2RUR8 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Otud7bB2RUR8 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Otud7bB2RUR8 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Otud7bB2RUR8 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Otud7bB2RUR8 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Otud7bB2RUR8 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Otud7bB2RUR8 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Otud7bB2RUR8 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Otud7bB2RUR8 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Otud7bB2RUR8 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Otud7bB2RUR8 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Otud7bB2RUR8 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Otud7bB2RUR8 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Otud7bB2RUR8 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Otud7bB2RUR8 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Otud7bB2RUR8 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Otud7bB2RUR8 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Otud7bB2RUR8 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Otud7bB2RUR8 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otud7bB2RUR8 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otud7bB2RUR8 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otud7bB2RUR8 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otud7bB2RUR8 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otud7bB2RUR8 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Otud7bB2RUR8 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otud7bB2RUR8 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otud7bB2RUR8 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otud7bB2RUR8 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otud7bB2RUR8 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otud7bB2RUR8 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Otud7bB2RUR8 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otud7bB2RUR8 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otud7bB2RUR8 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otud7bB2RUR8 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otud7bB2RUR8 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otud7bB2RUR8 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otud7bB2RUR8 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Otud7bB2RUR8 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Otud7bB2RUR8 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Otud7bB2RUR8 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Otud7bB2RUR8 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Otud7bB2RUR8 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Otud7bB2RUR8 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Otud7bB2RUR8 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Otud7bB2RUR8 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms