Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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