Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Apba1B2RUJ5 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Apba1B2RUJ5 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Apba1B2RUJ5 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Apba1B2RUJ5 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Apba1B2RUJ5 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Apba1B2RUJ5 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Apba1B2RUJ5 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Apba1B2RUJ5 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Apba1B2RUJ5 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Apba1B2RUJ5 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Apba1B2RUJ5 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Apba1B2RUJ5 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Apba1B2RUJ5 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Apba1B2RUJ5 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Apba1B2RUJ5 Irf2-209ENSMUST00000210218 535 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Apba1B2RUJ5 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Apba1B2RUJ5 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Apba1B2RUJ5 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Apba1B2RUJ5 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Apba1B2RUJ5 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Apba1B2RUJ5 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Apba1B2RUJ5 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Apba1B2RUJ5 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Apba1B2RUJ5 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Apba1B2RUJ5 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apba1B2RUJ5 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apba1B2RUJ5 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apba1B2RUJ5 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apba1B2RUJ5 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apba1B2RUJ5 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apba1B2RUJ5 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apba1B2RUJ5 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apba1B2RUJ5 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apba1B2RUJ5 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apba1B2RUJ5 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apba1B2RUJ5 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apba1B2RUJ5 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apba1B2RUJ5 Gm12439-201ENSMUST00000117162 365 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Apba1B2RUJ5 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apba1B2RUJ5 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apba1B2RUJ5 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apba1B2RUJ5 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apba1B2RUJ5 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apba1B2RUJ5 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apba1B2RUJ5 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apba1B2RUJ5 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apba1B2RUJ5 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apba1B2RUJ5 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apba1B2RUJ5 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apba1B2RUJ5 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apba1B2RUJ5 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apba1B2RUJ5 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Apba1B2RUJ5 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apba1B2RUJ5 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apba1B2RUJ5 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apba1B2RUJ5 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apba1B2RUJ5 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apba1B2RUJ5 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apba1B2RUJ5 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apba1B2RUJ5 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apba1B2RUJ5 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apba1B2RUJ5 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apba1B2RUJ5 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apba1B2RUJ5 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apba1B2RUJ5 Gm14399-202ENSMUST00000108929 813 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apba1B2RUJ5 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apba1B2RUJ5 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apba1B2RUJ5 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Apba1B2RUJ5 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apba1B2RUJ5 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apba1B2RUJ5 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apba1B2RUJ5 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apba1B2RUJ5 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apba1B2RUJ5 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apba1B2RUJ5 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apba1B2RUJ5 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apba1B2RUJ5 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apba1B2RUJ5 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apba1B2RUJ5 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apba1B2RUJ5 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apba1B2RUJ5 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apba1B2RUJ5 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apba1B2RUJ5 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apba1B2RUJ5 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apba1B2RUJ5 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apba1B2RUJ5 Gm17555-201ENSMUST00000164042 1113 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apba1B2RUJ5 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Apba1B2RUJ5 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apba1B2RUJ5 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Apba1B2RUJ5 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apba1B2RUJ5 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apba1B2RUJ5 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apba1B2RUJ5 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apba1B2RUJ5 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apba1B2RUJ5 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apba1B2RUJ5 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apba1B2RUJ5 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apba1B2RUJ5 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apba1B2RUJ5 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms