Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms