Protein–RNA interactions for Protein: B2RTN3

Zscan5b, Zinc finger and SCAN domain-containing 5B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan5bB2RTN3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms