Protein–RNA interactions for Protein: B2RT89

Slc22a28, Predicted gene, EG434674, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a28B2RT89 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc22a28B2RT89 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc22a28B2RT89 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc22a28B2RT89 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc22a28B2RT89 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc22a28B2RT89 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc22a28B2RT89 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc22a28B2RT89 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc22a28B2RT89 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc22a28B2RT89 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc22a28B2RT89 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc22a28B2RT89 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc22a28B2RT89 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc22a28B2RT89 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc22a28B2RT89 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc22a28B2RT89 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc22a28B2RT89 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc22a28B2RT89 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc22a28B2RT89 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc22a28B2RT89 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc22a28B2RT89 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc22a28B2RT89 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc22a28B2RT89 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc22a28B2RT89 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc22a28B2RT89 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc22a28B2RT89 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc22a28B2RT89 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc22a28B2RT89 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc22a28B2RT89 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc22a28B2RT89 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc22a28B2RT89 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc22a28B2RT89 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc22a28B2RT89 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc22a28B2RT89 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc22a28B2RT89 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc22a28B2RT89 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc22a28B2RT89 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc22a28B2RT89 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc22a28B2RT89 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc22a28B2RT89 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc22a28B2RT89 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc22a28B2RT89 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc22a28B2RT89 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc22a28B2RT89 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc22a28B2RT89 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc22a28B2RT89 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc22a28B2RT89 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc22a28B2RT89 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc22a28B2RT89 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc22a28B2RT89 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc22a28B2RT89 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc22a28B2RT89 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc22a28B2RT89 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc22a28B2RT89 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc22a28B2RT89 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc22a28B2RT89 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc22a28B2RT89 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc22a28B2RT89 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc22a28B2RT89 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc22a28B2RT89 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc22a28B2RT89 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc22a28B2RT89 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc22a28B2RT89 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc22a28B2RT89 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc22a28B2RT89 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc22a28B2RT89 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc22a28B2RT89 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc22a28B2RT89 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc22a28B2RT89 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc22a28B2RT89 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc22a28B2RT89 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc22a28B2RT89 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc22a28B2RT89 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc22a28B2RT89 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc22a28B2RT89 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc22a28B2RT89 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc22a28B2RT89 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc22a28B2RT89 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc22a28B2RT89 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc22a28B2RT89 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc22a28B2RT89 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc22a28B2RT89 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc22a28B2RT89 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc22a28B2RT89 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc22a28B2RT89 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc22a28B2RT89 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc22a28B2RT89 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc22a28B2RT89 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc22a28B2RT89 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc22a28B2RT89 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc22a28B2RT89 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc22a28B2RT89 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc22a28B2RT89 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc22a28B2RT89 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc22a28B2RT89 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc22a28B2RT89 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc22a28B2RT89 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc22a28B2RT89 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc22a28B2RT89 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc22a28B2RT89 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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