Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE4

Znf518b, Zinc finger protein 518B, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf518bB2RRE4 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Znf518bB2RRE4 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Znf518bB2RRE4 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf518bB2RRE4 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf518bB2RRE4 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf518bB2RRE4 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf518bB2RRE4 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf518bB2RRE4 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf518bB2RRE4 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf518bB2RRE4 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf518bB2RRE4 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf518bB2RRE4 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf518bB2RRE4 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf518bB2RRE4 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf518bB2RRE4 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf518bB2RRE4 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf518bB2RRE4 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf518bB2RRE4 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf518bB2RRE4 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf518bB2RRE4 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf518bB2RRE4 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf518bB2RRE4 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf518bB2RRE4 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf518bB2RRE4 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf518bB2RRE4 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf518bB2RRE4 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf518bB2RRE4 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf518bB2RRE4 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf518bB2RRE4 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf518bB2RRE4 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf518bB2RRE4 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms