Protein–RNA interactions for Protein: B2RR88

Zfp964, EG636741 protein, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp964B2RR88 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfp964B2RR88 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfp964B2RR88 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfp964B2RR88 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfp964B2RR88 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp964B2RR88 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp964B2RR88 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp964B2RR88 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp964B2RR88 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp964B2RR88 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp964B2RR88 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp964B2RR88 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp964B2RR88 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp964B2RR88 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp964B2RR88 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp964B2RR88 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp964B2RR88 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp964B2RR88 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp964B2RR88 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp964B2RR88 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp964B2RR88 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp964B2RR88 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp964B2RR88 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp964B2RR88 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp964B2RR88 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfp964B2RR88 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfp964B2RR88 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfp964B2RR88 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfp964B2RR88 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfp964B2RR88 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfp964B2RR88 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfp964B2RR88 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfp964B2RR88 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfp964B2RR88 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfp964B2RR88 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfp964B2RR88 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfp964B2RR88 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfp964B2RR88 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfp964B2RR88 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfp964B2RR88 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfp964B2RR88 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfp964B2RR88 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfp964B2RR88 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfp964B2RR88 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfp964B2RR88 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfp964B2RR88 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfp964B2RR88 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfp964B2RR88 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfp964B2RR88 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfp964B2RR88 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfp964B2RR88 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfp964B2RR88 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfp964B2RR88 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfp964B2RR88 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfp964B2RR88 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zfp964B2RR88 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zfp964B2RR88 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zfp964B2RR88 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zfp964B2RR88 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zfp964B2RR88 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Zfp964B2RR88 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zfp964B2RR88 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zfp964B2RR88 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zfp964B2RR88 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zfp964B2RR88 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zfp964B2RR88 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zfp964B2RR88 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zfp964B2RR88 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zfp964B2RR88 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zfp964B2RR88 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zfp964B2RR88 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zfp964B2RR88 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Zfp964B2RR88 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zfp964B2RR88 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zfp964B2RR88 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zfp964B2RR88 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zfp964B2RR88 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zfp964B2RR88 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zfp964B2RR88 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zfp964B2RR88 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zfp964B2RR88 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zfp964B2RR88 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zfp964B2RR88 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zfp964B2RR88 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zfp964B2RR88 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zfp964B2RR88 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zfp964B2RR88 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zfp964B2RR88 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zfp964B2RR88 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zfp964B2RR88 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Zfp964B2RR88 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zfp964B2RR88 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zfp964B2RR88 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zfp964B2RR88 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zfp964B2RR88 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zfp964B2RR88 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zfp964B2RR88 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zfp964B2RR88 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zfp964B2RR88 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zfp964B2RR88 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms