Protein–RNA interactions for Protein: B2RR83

Ythdc2, Probable ATP-dependent RNA helicase YTHDC2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc2B2RR83 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Ythdc2B2RR83 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ythdc2B2RR83 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ythdc2B2RR83 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ythdc2B2RR83 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ythdc2B2RR83 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ythdc2B2RR83 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ythdc2B2RR83 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ythdc2B2RR83 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ythdc2B2RR83 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ythdc2B2RR83 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ythdc2B2RR83 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ythdc2B2RR83 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Ythdc2B2RR83 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ythdc2B2RR83 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ythdc2B2RR83 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ythdc2B2RR83 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ythdc2B2RR83 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ythdc2B2RR83 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ythdc2B2RR83 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ythdc2B2RR83 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Ythdc2B2RR83 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ythdc2B2RR83 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ythdc2B2RR83 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ythdc2B2RR83 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ythdc2B2RR83 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ythdc2B2RR83 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ythdc2B2RR83 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ythdc2B2RR83 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Ythdc2B2RR83 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ythdc2B2RR83 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ythdc2B2RR83 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ythdc2B2RR83 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ythdc2B2RR83 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ythdc2B2RR83 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ythdc2B2RR83 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ythdc2B2RR83 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ythdc2B2RR83 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ythdc2B2RR83 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ythdc2B2RR83 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ythdc2B2RR83 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ythdc2B2RR83 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ythdc2B2RR83 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ythdc2B2RR83 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ythdc2B2RR83 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ythdc2B2RR83 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ythdc2B2RR83 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ythdc2B2RR83 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ythdc2B2RR83 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ythdc2B2RR83 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ythdc2B2RR83 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ythdc2B2RR83 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ythdc2B2RR83 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ythdc2B2RR83 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ythdc2B2RR83 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ythdc2B2RR83 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ythdc2B2RR83 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ythdc2B2RR83 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ythdc2B2RR83 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ythdc2B2RR83 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ythdc2B2RR83 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ythdc2B2RR83 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ythdc2B2RR83 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ythdc2B2RR83 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ythdc2B2RR83 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ythdc2B2RR83 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ythdc2B2RR83 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ythdc2B2RR83 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ythdc2B2RR83 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ythdc2B2RR83 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ythdc2B2RR83 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ythdc2B2RR83 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ythdc2B2RR83 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ythdc2B2RR83 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Ythdc2B2RR83 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ythdc2B2RR83 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ythdc2B2RR83 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ythdc2B2RR83 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ythdc2B2RR83 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ythdc2B2RR83 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ythdc2B2RR83 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ythdc2B2RR83 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ythdc2B2RR83 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ythdc2B2RR83 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ythdc2B2RR83 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ythdc2B2RR83 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ythdc2B2RR83 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ythdc2B2RR83 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ythdc2B2RR83 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ythdc2B2RR83 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ythdc2B2RR83 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ythdc2B2RR83 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ythdc2B2RR83 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ythdc2B2RR83 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ythdc2B2RR83 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ythdc2B2RR83 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ythdc2B2RR83 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ythdc2B2RR83 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ythdc2B2RR83 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ythdc2B2RR83 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms