Protein–RNA interactions for Protein: B1B213

H60c, Histocompatibility antigen 60c, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H60cB1B213 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H60cB1B213 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.04■□□□□ -0
H60cB1B213 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H60cB1B213 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H60cB1B213 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H60cB1B213 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
H60cB1B213 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H60cB1B213 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
H60cB1B213 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.04■□□□□ -0
H60cB1B213 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.04■□□□□ -0
H60cB1B213 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H60cB1B213 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H60cB1B213 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H60cB1B213 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H60cB1B213 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H60cB1B213 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
H60cB1B213 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H60cB1B213 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H60cB1B213 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H60cB1B213 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
H60cB1B213 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H60cB1B213 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H60cB1B213 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H60cB1B213 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H60cB1B213 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H60cB1B213 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H60cB1B213 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H60cB1B213 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H60cB1B213 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H60cB1B213 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H60cB1B213 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H60cB1B213 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H60cB1B213 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H60cB1B213 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
H60cB1B213 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H60cB1B213 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.03■□□□□ -0
H60cB1B213 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H60cB1B213 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H60cB1B213 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H60cB1B213 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H60cB1B213 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H60cB1B213 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H60cB1B213 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H60cB1B213 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H60cB1B213 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
H60cB1B213 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
H60cB1B213 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
H60cB1B213 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H60cB1B213 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
H60cB1B213 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H60cB1B213 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H60cB1B213 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H60cB1B213 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H60cB1B213 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H60cB1B213 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H60cB1B213 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H60cB1B213 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H60cB1B213 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
H60cB1B213 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H60cB1B213 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H60cB1B213 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H60cB1B213 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H60cB1B213 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H60cB1B213 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H60cB1B213 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
H60cB1B213 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H60cB1B213 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
H60cB1B213 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H60cB1B213 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.02■□□□□ -0
H60cB1B213 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H60cB1B213 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.02■□□□□ -0
H60cB1B213 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H60cB1B213 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H60cB1B213 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
H60cB1B213 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
H60cB1B213 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H60cB1B213 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H60cB1B213 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H60cB1B213 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H60cB1B213 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms