Protein–RNA interactions for Protein: B1B0V2

AU022751, Expressed sequence AU022751, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU022751B1B0V2 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AU022751B1B0V2 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AU022751B1B0V2 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AU022751B1B0V2 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AU022751B1B0V2 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AU022751B1B0V2 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
AU022751B1B0V2 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AU022751B1B0V2 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AU022751B1B0V2 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AU022751B1B0V2 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AU022751B1B0V2 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AU022751B1B0V2 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AU022751B1B0V2 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
AU022751B1B0V2 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AU022751B1B0V2 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AU022751B1B0V2 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AU022751B1B0V2 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AU022751B1B0V2 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AU022751B1B0V2 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AU022751B1B0V2 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AU022751B1B0V2 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AU022751B1B0V2 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AU022751B1B0V2 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AU022751B1B0V2 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AU022751B1B0V2 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AU022751B1B0V2 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
AU022751B1B0V2 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AU022751B1B0V2 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
AU022751B1B0V2 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AU022751B1B0V2 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
AU022751B1B0V2 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
AU022751B1B0V2 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AU022751B1B0V2 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AU022751B1B0V2 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AU022751B1B0V2 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AU022751B1B0V2 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
AU022751B1B0V2 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AU022751B1B0V2 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AU022751B1B0V2 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AU022751B1B0V2 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AU022751B1B0V2 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AU022751B1B0V2 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AU022751B1B0V2 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AU022751B1B0V2 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AU022751B1B0V2 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AU022751B1B0V2 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AU022751B1B0V2 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AU022751B1B0V2 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AU022751B1B0V2 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AU022751B1B0V2 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AU022751B1B0V2 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AU022751B1B0V2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AU022751B1B0V2 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AU022751B1B0V2 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AU022751B1B0V2 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AU022751B1B0V2 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AU022751B1B0V2 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AU022751B1B0V2 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AU022751B1B0V2 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AU022751B1B0V2 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AU022751B1B0V2 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AU022751B1B0V2 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AU022751B1B0V2 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
AU022751B1B0V2 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AU022751B1B0V2 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
AU022751B1B0V2 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
AU022751B1B0V2 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
AU022751B1B0V2 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AU022751B1B0V2 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AU022751B1B0V2 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AU022751B1B0V2 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AU022751B1B0V2 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AU022751B1B0V2 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
AU022751B1B0V2 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
AU022751B1B0V2 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
AU022751B1B0V2 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
AU022751B1B0V2 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
AU022751B1B0V2 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
AU022751B1B0V2 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
AU022751B1B0V2 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
AU022751B1B0V2 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AU022751B1B0V2 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AU022751B1B0V2 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AU022751B1B0V2 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AU022751B1B0V2 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AU022751B1B0V2 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AU022751B1B0V2 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AU022751B1B0V2 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AU022751B1B0V2 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AU022751B1B0V2 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AU022751B1B0V2 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AU022751B1B0V2 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
AU022751B1B0V2 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AU022751B1B0V2 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AU022751B1B0V2 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AU022751B1B0V2 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
AU022751B1B0V2 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
AU022751B1B0V2 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AU022751B1B0V2 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AU022751B1B0V2 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms