Protein–RNA interactions for Protein: B1AW18

4930402K13Rik, MCG54973, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930402K13RikB1AW18 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930402K13RikB1AW18 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930402K13RikB1AW18 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930402K13RikB1AW18 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930402K13RikB1AW18 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930402K13RikB1AW18 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930402K13RikB1AW18 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930402K13RikB1AW18 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930402K13RikB1AW18 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
4930402K13RikB1AW18 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930402K13RikB1AW18 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930402K13RikB1AW18 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930402K13RikB1AW18 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
4930402K13RikB1AW18 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
4930402K13RikB1AW18 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930402K13RikB1AW18 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930402K13RikB1AW18 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930402K13RikB1AW18 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
4930402K13RikB1AW18 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930402K13RikB1AW18 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
4930402K13RikB1AW18 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930402K13RikB1AW18 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930402K13RikB1AW18 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930402K13RikB1AW18 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930402K13RikB1AW18 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930402K13RikB1AW18 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930402K13RikB1AW18 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930402K13RikB1AW18 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930402K13RikB1AW18 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930402K13RikB1AW18 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930402K13RikB1AW18 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930402K13RikB1AW18 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930402K13RikB1AW18 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
4930402K13RikB1AW18 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
4930402K13RikB1AW18 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
4930402K13RikB1AW18 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
4930402K13RikB1AW18 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
4930402K13RikB1AW18 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
4930402K13RikB1AW18 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
4930402K13RikB1AW18 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
4930402K13RikB1AW18 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
4930402K13RikB1AW18 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
4930402K13RikB1AW18 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
4930402K13RikB1AW18 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
4930402K13RikB1AW18 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
4930402K13RikB1AW18 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
4930402K13RikB1AW18 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
4930402K13RikB1AW18 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms