Protein–RNA interactions for Protein: B1AVZ0

Uprt, Uracil phosphoribosyltransferase homolog, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UprtB1AVZ0 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UprtB1AVZ0 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UprtB1AVZ0 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UprtB1AVZ0 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UprtB1AVZ0 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UprtB1AVZ0 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UprtB1AVZ0 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UprtB1AVZ0 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UprtB1AVZ0 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UprtB1AVZ0 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UprtB1AVZ0 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UprtB1AVZ0 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UprtB1AVZ0 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UprtB1AVZ0 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UprtB1AVZ0 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UprtB1AVZ0 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UprtB1AVZ0 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UprtB1AVZ0 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UprtB1AVZ0 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UprtB1AVZ0 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UprtB1AVZ0 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
UprtB1AVZ0 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UprtB1AVZ0 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UprtB1AVZ0 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UprtB1AVZ0 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UprtB1AVZ0 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UprtB1AVZ0 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UprtB1AVZ0 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UprtB1AVZ0 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UprtB1AVZ0 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UprtB1AVZ0 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UprtB1AVZ0 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UprtB1AVZ0 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UprtB1AVZ0 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UprtB1AVZ0 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UprtB1AVZ0 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
UprtB1AVZ0 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UprtB1AVZ0 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UprtB1AVZ0 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UprtB1AVZ0 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UprtB1AVZ0 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UprtB1AVZ0 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UprtB1AVZ0 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UprtB1AVZ0 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UprtB1AVZ0 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UprtB1AVZ0 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UprtB1AVZ0 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UprtB1AVZ0 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UprtB1AVZ0 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UprtB1AVZ0 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UprtB1AVZ0 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UprtB1AVZ0 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UprtB1AVZ0 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UprtB1AVZ0 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UprtB1AVZ0 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UprtB1AVZ0 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
UprtB1AVZ0 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UprtB1AVZ0 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UprtB1AVZ0 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UprtB1AVZ0 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UprtB1AVZ0 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UprtB1AVZ0 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UprtB1AVZ0 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
UprtB1AVZ0 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
UprtB1AVZ0 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
UprtB1AVZ0 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
UprtB1AVZ0 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
UprtB1AVZ0 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UprtB1AVZ0 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
UprtB1AVZ0 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UprtB1AVZ0 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UprtB1AVZ0 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UprtB1AVZ0 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UprtB1AVZ0 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UprtB1AVZ0 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UprtB1AVZ0 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UprtB1AVZ0 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UprtB1AVZ0 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UprtB1AVZ0 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UprtB1AVZ0 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UprtB1AVZ0 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UprtB1AVZ0 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UprtB1AVZ0 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UprtB1AVZ0 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UprtB1AVZ0 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UprtB1AVZ0 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UprtB1AVZ0 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UprtB1AVZ0 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UprtB1AVZ0 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UprtB1AVZ0 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UprtB1AVZ0 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UprtB1AVZ0 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
UprtB1AVZ0 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UprtB1AVZ0 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UprtB1AVZ0 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UprtB1AVZ0 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UprtB1AVZ0 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UprtB1AVZ0 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
UprtB1AVZ0 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
UprtB1AVZ0 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms