Protein–RNA interactions for Protein: B1AV60

Nhs, NHS actin-remodeling regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NhsB1AV60 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NhsB1AV60 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NhsB1AV60 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NhsB1AV60 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NhsB1AV60 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NhsB1AV60 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NhsB1AV60 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NhsB1AV60 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NhsB1AV60 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NhsB1AV60 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NhsB1AV60 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NhsB1AV60 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NhsB1AV60 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NhsB1AV60 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NhsB1AV60 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NhsB1AV60 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NhsB1AV60 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NhsB1AV60 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NhsB1AV60 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NhsB1AV60 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NhsB1AV60 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NhsB1AV60 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NhsB1AV60 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NhsB1AV60 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NhsB1AV60 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NhsB1AV60 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NhsB1AV60 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NhsB1AV60 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NhsB1AV60 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
NhsB1AV60 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NhsB1AV60 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NhsB1AV60 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NhsB1AV60 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NhsB1AV60 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NhsB1AV60 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NhsB1AV60 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NhsB1AV60 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NhsB1AV60 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NhsB1AV60 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NhsB1AV60 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NhsB1AV60 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NhsB1AV60 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NhsB1AV60 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NhsB1AV60 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NhsB1AV60 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NhsB1AV60 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NhsB1AV60 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NhsB1AV60 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NhsB1AV60 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NhsB1AV60 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NhsB1AV60 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NhsB1AV60 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NhsB1AV60 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NhsB1AV60 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NhsB1AV60 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NhsB1AV60 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NhsB1AV60 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NhsB1AV60 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NhsB1AV60 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NhsB1AV60 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NhsB1AV60 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NhsB1AV60 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NhsB1AV60 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NhsB1AV60 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NhsB1AV60 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NhsB1AV60 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NhsB1AV60 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NhsB1AV60 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NhsB1AV60 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NhsB1AV60 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NhsB1AV60 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
NhsB1AV60 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NhsB1AV60 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
NhsB1AV60 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NhsB1AV60 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NhsB1AV60 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NhsB1AV60 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NhsB1AV60 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NhsB1AV60 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NhsB1AV60 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NhsB1AV60 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NhsB1AV60 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NhsB1AV60 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
NhsB1AV60 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NhsB1AV60 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NhsB1AV60 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NhsB1AV60 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NhsB1AV60 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NhsB1AV60 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NhsB1AV60 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NhsB1AV60 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NhsB1AV60 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NhsB1AV60 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NhsB1AV60 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NhsB1AV60 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NhsB1AV60 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NhsB1AV60 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NhsB1AV60 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NhsB1AV60 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NhsB1AV60 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms