Protein–RNA interactions for Protein: B1ARD8

Slfn8, Schlafen 8, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn8B1ARD8 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slfn8B1ARD8 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slfn8B1ARD8 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slfn8B1ARD8 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slfn8B1ARD8 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slfn8B1ARD8 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slfn8B1ARD8 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slfn8B1ARD8 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slfn8B1ARD8 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slfn8B1ARD8 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slfn8B1ARD8 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slfn8B1ARD8 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slfn8B1ARD8 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slfn8B1ARD8 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slfn8B1ARD8 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slfn8B1ARD8 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slfn8B1ARD8 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slfn8B1ARD8 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slfn8B1ARD8 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slfn8B1ARD8 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slfn8B1ARD8 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slfn8B1ARD8 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slfn8B1ARD8 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slfn8B1ARD8 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slfn8B1ARD8 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Slfn8B1ARD8 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Slfn8B1ARD8 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Slfn8B1ARD8 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slfn8B1ARD8 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slfn8B1ARD8 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slfn8B1ARD8 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slfn8B1ARD8 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slfn8B1ARD8 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slfn8B1ARD8 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slfn8B1ARD8 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slfn8B1ARD8 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Slfn8B1ARD8 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Slfn8B1ARD8 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Slfn8B1ARD8 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Slfn8B1ARD8 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slfn8B1ARD8 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slfn8B1ARD8 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slfn8B1ARD8 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slfn8B1ARD8 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slfn8B1ARD8 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slfn8B1ARD8 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slfn8B1ARD8 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slfn8B1ARD8 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slfn8B1ARD8 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slfn8B1ARD8 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slfn8B1ARD8 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slfn8B1ARD8 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slfn8B1ARD8 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slfn8B1ARD8 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slfn8B1ARD8 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Slfn8B1ARD8 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slfn8B1ARD8 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slfn8B1ARD8 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slfn8B1ARD8 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Slfn8B1ARD8 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slfn8B1ARD8 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slfn8B1ARD8 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slfn8B1ARD8 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slfn8B1ARD8 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slfn8B1ARD8 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slfn8B1ARD8 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slfn8B1ARD8 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slfn8B1ARD8 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slfn8B1ARD8 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slfn8B1ARD8 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slfn8B1ARD8 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slfn8B1ARD8 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Slfn8B1ARD8 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Slfn8B1ARD8 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slfn8B1ARD8 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slfn8B1ARD8 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slfn8B1ARD8 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slfn8B1ARD8 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slfn8B1ARD8 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slfn8B1ARD8 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slfn8B1ARD8 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slfn8B1ARD8 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slfn8B1ARD8 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slfn8B1ARD8 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slfn8B1ARD8 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slfn8B1ARD8 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slfn8B1ARD8 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slfn8B1ARD8 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slfn8B1ARD8 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slfn8B1ARD8 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slfn8B1ARD8 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slfn8B1ARD8 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slfn8B1ARD8 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slfn8B1ARD8 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Slfn8B1ARD8 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slfn8B1ARD8 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slfn8B1ARD8 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slfn8B1ARD8 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slfn8B1ARD8 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slfn8B1ARD8 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms