Protein–RNA interactions for Protein: B1AQJ2

Usp36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp36B1AQJ2 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp36B1AQJ2 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp36B1AQJ2 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp36B1AQJ2 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp36B1AQJ2 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp36B1AQJ2 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp36B1AQJ2 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp36B1AQJ2 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp36B1AQJ2 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp36B1AQJ2 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp36B1AQJ2 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp36B1AQJ2 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp36B1AQJ2 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp36B1AQJ2 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp36B1AQJ2 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp36B1AQJ2 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp36B1AQJ2 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp36B1AQJ2 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp36B1AQJ2 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp36B1AQJ2 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp36B1AQJ2 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp36B1AQJ2 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp36B1AQJ2 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp36B1AQJ2 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp36B1AQJ2 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp36B1AQJ2 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp36B1AQJ2 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp36B1AQJ2 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp36B1AQJ2 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp36B1AQJ2 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp36B1AQJ2 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp36B1AQJ2 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp36B1AQJ2 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp36B1AQJ2 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp36B1AQJ2 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Usp36B1AQJ2 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Usp36B1AQJ2 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp36B1AQJ2 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp36B1AQJ2 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp36B1AQJ2 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp36B1AQJ2 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp36B1AQJ2 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp36B1AQJ2 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp36B1AQJ2 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Usp36B1AQJ2 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp36B1AQJ2 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp36B1AQJ2 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Usp36B1AQJ2 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp36B1AQJ2 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp36B1AQJ2 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp36B1AQJ2 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Usp36B1AQJ2 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Usp36B1AQJ2 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Usp36B1AQJ2 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp36B1AQJ2 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Usp36B1AQJ2 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp36B1AQJ2 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp36B1AQJ2 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp36B1AQJ2 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp36B1AQJ2 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp36B1AQJ2 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp36B1AQJ2 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp36B1AQJ2 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp36B1AQJ2 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp36B1AQJ2 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp36B1AQJ2 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp36B1AQJ2 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp36B1AQJ2 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp36B1AQJ2 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp36B1AQJ2 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp36B1AQJ2 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp36B1AQJ2 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp36B1AQJ2 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp36B1AQJ2 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp36B1AQJ2 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp36B1AQJ2 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp36B1AQJ2 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp36B1AQJ2 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp36B1AQJ2 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp36B1AQJ2 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp36B1AQJ2 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp36B1AQJ2 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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