Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm6880A3KG45 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6880A3KG45 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6880A3KG45 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6880A3KG45 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6880A3KG45 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6880A3KG45 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6880A3KG45 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6880A3KG45 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6880A3KG45 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6880A3KG45 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm6880A3KG45 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm6880A3KG45 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6880A3KG45 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6880A3KG45 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6880A3KG45 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6880A3KG45 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6880A3KG45 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6880A3KG45 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6880A3KG45 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6880A3KG45 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6880A3KG45 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6880A3KG45 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm6880A3KG45 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6880A3KG45 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6880A3KG45 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6880A3KG45 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6880A3KG45 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6880A3KG45 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6880A3KG45 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6880A3KG45 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6880A3KG45 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6880A3KG45 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6880A3KG45 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6880A3KG45 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6880A3KG45 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm6880A3KG45 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm6880A3KG45 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm6880A3KG45 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm6880A3KG45 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm6880A3KG45 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm6880A3KG45 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm6880A3KG45 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm6880A3KG45 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm6880A3KG45 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm6880A3KG45 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm6880A3KG45 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm6880A3KG45 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm6880A3KG45 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm6880A3KG45 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm6880A3KG45 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm6880A3KG45 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm6880A3KG45 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm6880A3KG45 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm6880A3KG45 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm6880A3KG45 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm6880A3KG45 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6880A3KG45 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6880A3KG45 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6880A3KG45 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6880A3KG45 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6880A3KG45 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6880A3KG45 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6880A3KG45 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6880A3KG45 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6880A3KG45 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6880A3KG45 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6880A3KG45 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6880A3KG45 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6880A3KG45 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm6880A3KG45 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6880A3KG45 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6880A3KG45 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6880A3KG45 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm6880A3KG45 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6880A3KG45 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6880A3KG45 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6880A3KG45 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6880A3KG45 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6880A3KG45 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6880A3KG45 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6880A3KG45 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6880A3KG45 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6880A3KG45 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6880A3KG45 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6880A3KG45 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6880A3KG45 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6880A3KG45 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6880A3KG45 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6880A3KG45 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6880A3KG45 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6880A3KG45 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6880A3KG45 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6880A3KG45 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6880A3KG45 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6880A3KG45 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6880A3KG45 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6880A3KG45 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6880A3KG45 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6880A3KG45 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms