Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms