Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms