Protein–RNA interactions for Protein: A2AMT6

Vmn1r2, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r2A2AMT6 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms