Protein–RNA interactions for Protein: A2AMM0

Cavin4, Caveolae-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cavin4A2AMM0 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cavin4A2AMM0 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cavin4A2AMM0 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cavin4A2AMM0 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cavin4A2AMM0 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cavin4A2AMM0 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cavin4A2AMM0 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cavin4A2AMM0 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cavin4A2AMM0 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cavin4A2AMM0 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cavin4A2AMM0 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cavin4A2AMM0 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cavin4A2AMM0 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cavin4A2AMM0 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cavin4A2AMM0 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cavin4A2AMM0 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cavin4A2AMM0 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Cavin4A2AMM0 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cavin4A2AMM0 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cavin4A2AMM0 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Cavin4A2AMM0 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cavin4A2AMM0 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cavin4A2AMM0 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cavin4A2AMM0 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cavin4A2AMM0 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cavin4A2AMM0 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cavin4A2AMM0 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cavin4A2AMM0 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cavin4A2AMM0 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cavin4A2AMM0 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cavin4A2AMM0 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cavin4A2AMM0 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cavin4A2AMM0 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cavin4A2AMM0 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Cavin4A2AMM0 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cavin4A2AMM0 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cavin4A2AMM0 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cavin4A2AMM0 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cavin4A2AMM0 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cavin4A2AMM0 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cavin4A2AMM0 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cavin4A2AMM0 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cavin4A2AMM0 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cavin4A2AMM0 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cavin4A2AMM0 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cavin4A2AMM0 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cavin4A2AMM0 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cavin4A2AMM0 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cavin4A2AMM0 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cavin4A2AMM0 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cavin4A2AMM0 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cavin4A2AMM0 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cavin4A2AMM0 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cavin4A2AMM0 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cavin4A2AMM0 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cavin4A2AMM0 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cavin4A2AMM0 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cavin4A2AMM0 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cavin4A2AMM0 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cavin4A2AMM0 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cavin4A2AMM0 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cavin4A2AMM0 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cavin4A2AMM0 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Cavin4A2AMM0 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cavin4A2AMM0 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cavin4A2AMM0 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cavin4A2AMM0 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cavin4A2AMM0 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cavin4A2AMM0 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cavin4A2AMM0 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cavin4A2AMM0 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cavin4A2AMM0 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cavin4A2AMM0 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cavin4A2AMM0 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cavin4A2AMM0 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cavin4A2AMM0 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cavin4A2AMM0 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cavin4A2AMM0 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cavin4A2AMM0 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Cavin4A2AMM0 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cavin4A2AMM0 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cavin4A2AMM0 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cavin4A2AMM0 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cavin4A2AMM0 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cavin4A2AMM0 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cavin4A2AMM0 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cavin4A2AMM0 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cavin4A2AMM0 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cavin4A2AMM0 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cavin4A2AMM0 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cavin4A2AMM0 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cavin4A2AMM0 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cavin4A2AMM0 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Cavin4A2AMM0 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cavin4A2AMM0 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cavin4A2AMM0 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cavin4A2AMM0 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cavin4A2AMM0 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cavin4A2AMM0 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cavin4A2AMM0 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms