Protein–RNA interactions for Protein: A2AIR5

Grin3a, Glutamate receptor ionotropic, NMDA3A, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin3aA2AIR5 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grin3aA2AIR5 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grin3aA2AIR5 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grin3aA2AIR5 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Grin3aA2AIR5 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grin3aA2AIR5 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grin3aA2AIR5 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grin3aA2AIR5 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grin3aA2AIR5 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grin3aA2AIR5 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grin3aA2AIR5 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grin3aA2AIR5 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grin3aA2AIR5 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grin3aA2AIR5 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grin3aA2AIR5 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grin3aA2AIR5 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grin3aA2AIR5 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grin3aA2AIR5 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grin3aA2AIR5 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin3aA2AIR5 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin3aA2AIR5 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin3aA2AIR5 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin3aA2AIR5 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin3aA2AIR5 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin3aA2AIR5 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin3aA2AIR5 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin3aA2AIR5 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin3aA2AIR5 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin3aA2AIR5 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin3aA2AIR5 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin3aA2AIR5 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin3aA2AIR5 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin3aA2AIR5 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin3aA2AIR5 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin3aA2AIR5 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin3aA2AIR5 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin3aA2AIR5 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin3aA2AIR5 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin3aA2AIR5 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin3aA2AIR5 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grin3aA2AIR5 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grin3aA2AIR5 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grin3aA2AIR5 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grin3aA2AIR5 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grin3aA2AIR5 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grin3aA2AIR5 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grin3aA2AIR5 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grin3aA2AIR5 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grin3aA2AIR5 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grin3aA2AIR5 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grin3aA2AIR5 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grin3aA2AIR5 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grin3aA2AIR5 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grin3aA2AIR5 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grin3aA2AIR5 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grin3aA2AIR5 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grin3aA2AIR5 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grin3aA2AIR5 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grin3aA2AIR5 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grin3aA2AIR5 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grin3aA2AIR5 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grin3aA2AIR5 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grin3aA2AIR5 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grin3aA2AIR5 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grin3aA2AIR5 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grin3aA2AIR5 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grin3aA2AIR5 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grin3aA2AIR5 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grin3aA2AIR5 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grin3aA2AIR5 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grin3aA2AIR5 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grin3aA2AIR5 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grin3aA2AIR5 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grin3aA2AIR5 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grin3aA2AIR5 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grin3aA2AIR5 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grin3aA2AIR5 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grin3aA2AIR5 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grin3aA2AIR5 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grin3aA2AIR5 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grin3aA2AIR5 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grin3aA2AIR5 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grin3aA2AIR5 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grin3aA2AIR5 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Grin3aA2AIR5 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grin3aA2AIR5 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grin3aA2AIR5 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grin3aA2AIR5 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grin3aA2AIR5 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grin3aA2AIR5 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grin3aA2AIR5 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grin3aA2AIR5 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grin3aA2AIR5 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grin3aA2AIR5 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grin3aA2AIR5 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grin3aA2AIR5 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grin3aA2AIR5 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grin3aA2AIR5 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grin3aA2AIR5 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grin3aA2AIR5 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms