Protein–RNA interactions for Protein: A2AGT5

Ckap5, Cytoskeleton-associated protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap5A2AGT5 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ckap5A2AGT5 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ckap5A2AGT5 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ckap5A2AGT5 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ckap5A2AGT5 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ckap5A2AGT5 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ckap5A2AGT5 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ckap5A2AGT5 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ckap5A2AGT5 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ckap5A2AGT5 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ckap5A2AGT5 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ckap5A2AGT5 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ckap5A2AGT5 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ckap5A2AGT5 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ckap5A2AGT5 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ckap5A2AGT5 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ckap5A2AGT5 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ckap5A2AGT5 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ckap5A2AGT5 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ckap5A2AGT5 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ckap5A2AGT5 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ckap5A2AGT5 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ckap5A2AGT5 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ckap5A2AGT5 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ckap5A2AGT5 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ckap5A2AGT5 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ckap5A2AGT5 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ckap5A2AGT5 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ckap5A2AGT5 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ckap5A2AGT5 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ckap5A2AGT5 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ckap5A2AGT5 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ckap5A2AGT5 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ckap5A2AGT5 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ckap5A2AGT5 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ckap5A2AGT5 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ckap5A2AGT5 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ckap5A2AGT5 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ckap5A2AGT5 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ckap5A2AGT5 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ckap5A2AGT5 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ckap5A2AGT5 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ckap5A2AGT5 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ckap5A2AGT5 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ckap5A2AGT5 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ckap5A2AGT5 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ckap5A2AGT5 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ckap5A2AGT5 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ckap5A2AGT5 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ckap5A2AGT5 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ckap5A2AGT5 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ckap5A2AGT5 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ckap5A2AGT5 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ckap5A2AGT5 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ckap5A2AGT5 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ckap5A2AGT5 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ckap5A2AGT5 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ckap5A2AGT5 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ckap5A2AGT5 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ckap5A2AGT5 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ckap5A2AGT5 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ckap5A2AGT5 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ckap5A2AGT5 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ckap5A2AGT5 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ckap5A2AGT5 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ckap5A2AGT5 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ckap5A2AGT5 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ckap5A2AGT5 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ckap5A2AGT5 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ckap5A2AGT5 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ckap5A2AGT5 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ckap5A2AGT5 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ckap5A2AGT5 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ckap5A2AGT5 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ckap5A2AGT5 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ckap5A2AGT5 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ckap5A2AGT5 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ckap5A2AGT5 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ckap5A2AGT5 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ckap5A2AGT5 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ckap5A2AGT5 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ckap5A2AGT5 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ckap5A2AGT5 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ckap5A2AGT5 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ckap5A2AGT5 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ckap5A2AGT5 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ckap5A2AGT5 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ckap5A2AGT5 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ckap5A2AGT5 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ckap5A2AGT5 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ckap5A2AGT5 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ckap5A2AGT5 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ckap5A2AGT5 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ckap5A2AGT5 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ckap5A2AGT5 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ckap5A2AGT5 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ckap5A2AGT5 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ckap5A2AGT5 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ckap5A2AGT5 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
Ckap5A2AGT5 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms