Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Frmpd4A2AFR3 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Frmpd4A2AFR3 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Frmpd4A2AFR3 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Frmpd4A2AFR3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Frmpd4A2AFR3 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Frmpd4A2AFR3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Frmpd4A2AFR3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Frmpd4A2AFR3 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Frmpd4A2AFR3 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Frmpd4A2AFR3 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Frmpd4A2AFR3 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Frmpd4A2AFR3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Frmpd4A2AFR3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Frmpd4A2AFR3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Frmpd4A2AFR3 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Frmpd4A2AFR3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Frmpd4A2AFR3 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Frmpd4A2AFR3 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Frmpd4A2AFR3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Frmpd4A2AFR3 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Frmpd4A2AFR3 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Frmpd4A2AFR3 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Frmpd4A2AFR3 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Frmpd4A2AFR3 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Frmpd4A2AFR3 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Frmpd4A2AFR3 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Frmpd4A2AFR3 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Frmpd4A2AFR3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Frmpd4A2AFR3 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Frmpd4A2AFR3 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Frmpd4A2AFR3 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Frmpd4A2AFR3 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Frmpd4A2AFR3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Frmpd4A2AFR3 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Frmpd4A2AFR3 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Frmpd4A2AFR3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Frmpd4A2AFR3 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Frmpd4A2AFR3 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Frmpd4A2AFR3 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Frmpd4A2AFR3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Frmpd4A2AFR3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Frmpd4A2AFR3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Frmpd4A2AFR3 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Frmpd4A2AFR3 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Frmpd4A2AFR3 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Frmpd4A2AFR3 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Frmpd4A2AFR3 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Frmpd4A2AFR3 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Frmpd4A2AFR3 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Frmpd4A2AFR3 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Frmpd4A2AFR3 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Frmpd4A2AFR3 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Frmpd4A2AFR3 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Frmpd4A2AFR3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Frmpd4A2AFR3 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Frmpd4A2AFR3 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Frmpd4A2AFR3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Frmpd4A2AFR3 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Frmpd4A2AFR3 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Frmpd4A2AFR3 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Frmpd4A2AFR3 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Frmpd4A2AFR3 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Frmpd4A2AFR3 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Frmpd4A2AFR3 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Frmpd4A2AFR3 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Frmpd4A2AFR3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Frmpd4A2AFR3 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Frmpd4A2AFR3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Frmpd4A2AFR3 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Frmpd4A2AFR3 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Frmpd4A2AFR3 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Frmpd4A2AFR3 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Frmpd4A2AFR3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Frmpd4A2AFR3 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Frmpd4A2AFR3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Frmpd4A2AFR3 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Frmpd4A2AFR3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Frmpd4A2AFR3 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Frmpd4A2AFR3 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Frmpd4A2AFR3 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Frmpd4A2AFR3 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Frmpd4A2AFR3 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Frmpd4A2AFR3 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Frmpd4A2AFR3 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Frmpd4A2AFR3 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Frmpd4A2AFR3 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Frmpd4A2AFR3 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Frmpd4A2AFR3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Frmpd4A2AFR3 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms