Protein–RNA interactions for Protein: A2A863

Itgb4, Integrin beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb4A2A863 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itgb4A2A863 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itgb4A2A863 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itgb4A2A863 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itgb4A2A863 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itgb4A2A863 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itgb4A2A863 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itgb4A2A863 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itgb4A2A863 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itgb4A2A863 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itgb4A2A863 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itgb4A2A863 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itgb4A2A863 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itgb4A2A863 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itgb4A2A863 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itgb4A2A863 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itgb4A2A863 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itgb4A2A863 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itgb4A2A863 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itgb4A2A863 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itgb4A2A863 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itgb4A2A863 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itgb4A2A863 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itgb4A2A863 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Itgb4A2A863 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itgb4A2A863 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itgb4A2A863 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itgb4A2A863 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itgb4A2A863 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itgb4A2A863 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itgb4A2A863 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itgb4A2A863 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itgb4A2A863 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itgb4A2A863 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itgb4A2A863 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itgb4A2A863 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itgb4A2A863 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itgb4A2A863 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itgb4A2A863 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itgb4A2A863 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itgb4A2A863 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itgb4A2A863 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itgb4A2A863 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itgb4A2A863 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Itgb4A2A863 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itgb4A2A863 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itgb4A2A863 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Itgb4A2A863 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itgb4A2A863 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itgb4A2A863 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Itgb4A2A863 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Itgb4A2A863 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Itgb4A2A863 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Itgb4A2A863 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Itgb4A2A863 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Itgb4A2A863 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Itgb4A2A863 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Itgb4A2A863 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Itgb4A2A863 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Itgb4A2A863 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Itgb4A2A863 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Itgb4A2A863 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Itgb4A2A863 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Itgb4A2A863 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Itgb4A2A863 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Itgb4A2A863 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Itgb4A2A863 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Itgb4A2A863 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Itgb4A2A863 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Itgb4A2A863 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itgb4A2A863 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Itgb4A2A863 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itgb4A2A863 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itgb4A2A863 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itgb4A2A863 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itgb4A2A863 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itgb4A2A863 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itgb4A2A863 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itgb4A2A863 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itgb4A2A863 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itgb4A2A863 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Itgb4A2A863 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itgb4A2A863 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Itgb4A2A863 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itgb4A2A863 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itgb4A2A863 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itgb4A2A863 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itgb4A2A863 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itgb4A2A863 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Itgb4A2A863 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Itgb4A2A863 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Itgb4A2A863 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Itgb4A2A863 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Itgb4A2A863 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Itgb4A2A863 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Itgb4A2A863 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Itgb4A2A863 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Itgb4A2A863 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Itgb4A2A863 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Itgb4A2A863 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms