Protein–RNA interactions for Protein: A2A7F4

Rlf, MCG122876, mousemouse

Predictions only

Length 1,918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RlfA2A7F4 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RlfA2A7F4 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RlfA2A7F4 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RlfA2A7F4 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RlfA2A7F4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RlfA2A7F4 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RlfA2A7F4 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RlfA2A7F4 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RlfA2A7F4 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RlfA2A7F4 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RlfA2A7F4 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RlfA2A7F4 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RlfA2A7F4 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RlfA2A7F4 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RlfA2A7F4 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RlfA2A7F4 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RlfA2A7F4 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RlfA2A7F4 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RlfA2A7F4 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RlfA2A7F4 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RlfA2A7F4 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RlfA2A7F4 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RlfA2A7F4 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RlfA2A7F4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RlfA2A7F4 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RlfA2A7F4 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RlfA2A7F4 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RlfA2A7F4 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RlfA2A7F4 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RlfA2A7F4 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RlfA2A7F4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RlfA2A7F4 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RlfA2A7F4 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RlfA2A7F4 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RlfA2A7F4 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RlfA2A7F4 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RlfA2A7F4 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RlfA2A7F4 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RlfA2A7F4 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RlfA2A7F4 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RlfA2A7F4 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RlfA2A7F4 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RlfA2A7F4 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RlfA2A7F4 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RlfA2A7F4 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RlfA2A7F4 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RlfA2A7F4 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RlfA2A7F4 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RlfA2A7F4 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RlfA2A7F4 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RlfA2A7F4 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RlfA2A7F4 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RlfA2A7F4 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RlfA2A7F4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RlfA2A7F4 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RlfA2A7F4 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RlfA2A7F4 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RlfA2A7F4 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms