Protein–RNA interactions for Protein: A0JLY1

Ccdc173, Coiled-coil domain-containing protein 173, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc173A0JLY1 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc173A0JLY1 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc173A0JLY1 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc173A0JLY1 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc173A0JLY1 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc173A0JLY1 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc173A0JLY1 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc173A0JLY1 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc173A0JLY1 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc173A0JLY1 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc173A0JLY1 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc173A0JLY1 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc173A0JLY1 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc173A0JLY1 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc173A0JLY1 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc173A0JLY1 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc173A0JLY1 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc173A0JLY1 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc173A0JLY1 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc173A0JLY1 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc173A0JLY1 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc173A0JLY1 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc173A0JLY1 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc173A0JLY1 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc173A0JLY1 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc173A0JLY1 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc173A0JLY1 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc173A0JLY1 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc173A0JLY1 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc173A0JLY1 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms