Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GSI2

1700018G05Rik, RIKEN cDNA 1700018G05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms