Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RNP2

Uncharacterized protein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RNP2 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
A0A0U1RNP2 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
A0A0U1RNP2 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
A0A0U1RNP2 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
A0A0U1RNP2 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
A0A0U1RNP2 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
A0A0U1RNP2 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
A0A0U1RNP2 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
A0A0U1RNP2 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
A0A0U1RNP2 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
A0A0U1RNP2 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
A0A0U1RNP2 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
A0A0U1RNP2 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
A0A0U1RNP2 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
A0A0U1RNP2 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
A0A0U1RNP2 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
A0A0U1RNP2 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
A0A0U1RNP2 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
A0A0U1RNP2 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
A0A0U1RNP2 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
A0A0U1RNP2 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
A0A0U1RNP2 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
A0A0U1RNP2 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
A0A0U1RNP2 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
A0A0U1RNP2 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
A0A0U1RNP2 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
A0A0U1RNP2 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
A0A0U1RNP2 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
A0A0U1RNP2 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
A0A0U1RNP2 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
A0A0U1RNP2 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
A0A0U1RNP2 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
A0A0U1RNP2 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
A0A0U1RNP2 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
A0A0U1RNP2 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
A0A0U1RNP2 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
A0A0U1RNP2 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
A0A0U1RNP2 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
A0A0U1RNP2 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
A0A0U1RNP2 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
A0A0U1RNP2 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
A0A0U1RNP2 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
A0A0U1RNP2 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
A0A0U1RNP2 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
A0A0U1RNP2 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
A0A0U1RNP2 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
A0A0U1RNP2 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
A0A0U1RNP2 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
A0A0U1RNP2 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
A0A0U1RNP2 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
A0A0U1RNP2 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
A0A0U1RNP2 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
A0A0U1RNP2 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
A0A0U1RNP2 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
A0A0U1RNP2 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
A0A0U1RNP2 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
A0A0U1RNP2 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
A0A0U1RNP2 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
A0A0U1RNP2 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
A0A0U1RNP2 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
A0A0U1RNP2 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
A0A0U1RNP2 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
A0A0U1RNP2 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
A0A0U1RNP2 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
A0A0U1RNP2 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
A0A0U1RNP2 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
A0A0U1RNP2 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
A0A0U1RNP2 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
A0A0U1RNP2 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
A0A0U1RNP2 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
A0A0U1RNP2 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
A0A0U1RNP2 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
A0A0U1RNP2 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
A0A0U1RNP2 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
A0A0U1RNP2 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
A0A0U1RNP2 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
A0A0U1RNP2 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
A0A0U1RNP2 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
A0A0U1RNP2 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
A0A0U1RNP2 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
A0A0U1RNP2 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
A0A0U1RNP2 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
A0A0U1RNP2 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
A0A0U1RNP2 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
A0A0U1RNP2 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
A0A0U1RNP2 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
A0A0U1RNP2 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
A0A0U1RNP2 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
A0A0U1RNP2 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
A0A0U1RNP2 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
A0A0U1RNP2 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
A0A0U1RNP2 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
A0A0U1RNP2 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
A0A0U1RNP2 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
A0A0U1RNP2 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
A0A0U1RNP2 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
A0A0U1RNP2 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
A0A0U1RNP2 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
A0A0U1RNP2 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
A0A0U1RNP2 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms