Protein–RNA interactions for Protein: A0A0R4J054

4921501E09Rik, RIKEN cDNA 4921501E09, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921501E09RikA0A0R4J054 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
4921501E09RikA0A0R4J054 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
4921501E09RikA0A0R4J054 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms