Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC9.44□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.43□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.43□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC9.43□□□□□ -0.9
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.42□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC9.42□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
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