Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YUW3

Gm5141, Predicted gene 5141, mousemouse

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5141A0A0J9YUW3 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5141A0A0J9YUW3 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5141A0A0J9YUW3 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5141A0A0J9YUW3 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5141A0A0J9YUW3 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5141A0A0J9YUW3 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5141A0A0J9YUW3 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5141A0A0J9YUW3 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5141A0A0J9YUW3 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5141A0A0J9YUW3 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5141A0A0J9YUW3 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5141A0A0J9YUW3 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5141A0A0J9YUW3 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5141A0A0J9YUW3 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5141A0A0J9YUW3 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5141A0A0J9YUW3 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5141A0A0J9YUW3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5141A0A0J9YUW3 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5141A0A0J9YUW3 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5141A0A0J9YUW3 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5141A0A0J9YUW3 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5141A0A0J9YUW3 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5141A0A0J9YUW3 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5141A0A0J9YUW3 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5141A0A0J9YUW3 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5141A0A0J9YUW3 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5141A0A0J9YUW3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5141A0A0J9YUW3 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5141A0A0J9YUW3 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5141A0A0J9YUW3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5141A0A0J9YUW3 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5141A0A0J9YUW3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5141A0A0J9YUW3 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5141A0A0J9YUW3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5141A0A0J9YUW3 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5141A0A0J9YUW3 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5141A0A0J9YUW3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5141A0A0J9YUW3 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms