Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YTW6

Scn2a, Sodium channel protein, mousemouse

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Length 2,006 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Scn2aA0A0J9YTW6 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Scn2aA0A0J9YTW6 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Scn2aA0A0J9YTW6 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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