Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P5

Trbv26, T cell receptor beta, variable 26 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv26A0A0B4J1P5 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Trbv26A0A0B4J1P5 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Trbv26A0A0B4J1P5 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Trbv26A0A0B4J1P5 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Trbv26A0A0B4J1P5 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Trbv26A0A0B4J1P5 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Trbv26A0A0B4J1P5 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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